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大部分濾紙由棉質纖維組成，按不同的用途而使用不同的方法製作。由於其材質是纖維製成品，因此它的表麵有無數小孔可供液體粒子通過，而體積較大的固體粒子則不能通過。這種性質容許混合在一起的液態及固態物質分離。
一般的紙層析實際上是以濾紙纖維的結合水為固定相，以有機溶劑為流動相，當流動相沿紙經過樣品時，樣品點上的溶質在水和有機相之間不斷進行分配，一部分樣品隨流動相移動，進入無溶質區，此時又重新分配，一部分溶質由流動相進入固定相(水相)。隨著流動相的不斷移動，各種不同的部分按其各自的分配係數不斷進行分配，並沿著流動相移動，從而使物質得到分離和提純。
濾紙是一種常見於化學實驗室的過濾工具，常見的形狀是圓形（方形濾紙也有），多由棉質纖維製成。濾紙一般可分為定性及定量兩種。
濾紙的性質：
1.選擇合適的濾紙可透過考慮以下四種因素而作決定。
2.硬度:濾紙在過濾時會變濕，一些長時間過濾的實驗步驟應考慮使用濕水後較堅韌的濾紙。
3.過濾效率:濾紙上滲水小孔的疏密程度及大小，影響著它的過濾效率。高效率的濾紙過濾速度既快，而且分辨率也高。
4.容量:過濾時積存的固體顆粒或會阻塞濾紙上的小孔，因此滲水小孔愈密集，也就表示其容量愈高，容許過濾的濾汶愈多。
5.適用性:有些濾紙是采用特殊的製作步驟而完成的，例如在檢驗醫藥中用於測定血液中的氮含量，必須使用無氮濾紙等。
6.注意濾紙不能過濾氯化鋅，否則濾紙將被氯化鋅腐蝕破損
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